دانشکده فلسفه و اخلاق یکی از مراکز مهم فعالیت‌های فلسفی در دانشگاه باقرالعلوم(ع) است. این دانشکده با هدف توسعه اندیشه فلسفی اسلامی و بررسی مسائل بنیادین معرفتی فعالیت می‌کند.

گروه‌های علمی این دانشکده در حوزه‌هایی مانند فلسفه اسلامی، فلسفه دین، فلسفه‌های مضاف و اخلاق کاربردی به آموزش و پژوهش می‌پردازند و با بهره‌گیری از سنت فلسفی اسلامی و دستاوردهای فلسفه معاصر به تحلیل مسائل نظری و معرفتی می‌پردازند.