روسای دانشگاه از آغاز تاکنون
مسیر علمی و تشکیلاتی دانشگاه باقرالعلوم(ع) از سال 1372 تا کنون با راهبری شش رئیس طی شده است و از شهریورماه 1405، سرپرستی دانشگاه بر عهده حجت الاسلام والمسلمین دکتر مریجی قرار گرفته است.
هر دوره مدیریتی با تلاشهای قابل توجهی در توسعه علمی و ارتقای جایگاه دانشگاه همراه بوده است:
دکتر سید محمدتقی آلسیدغفور
(۱۳۷۲–۱۳۸۲)
دکتر حمید پارسانیا
(۱۳۸۲–۱۳۸۶)
دکتر احمد واعظی
(۱۳۸۶–۱۳۸۸)
دکتر محمدجواد ارسطا
(۱۳۸۸–۱۳۹۰)
دکتر شمسالله مریجی
(۱۳۹۰–۱۴۰۳)
دکتر سیداحسان رفیعی علوی
(۱405-1403)
